地名“豬苗代”的由來眾說不一。有來自磐椅神社的磐椅明神讓野豬耕地的神話的說法，還有來自日本阿伊努民族的土語的說法。不論哪種說法都與種植水稻深切相關。
古代磐梯山與貓魔火山的大規模噴發逐漸形成現在豬苗代的地形。大約四、五萬年前，現代的地形基本固定。估計一萬二千年前就有土著居民住在湖畔。
在面對豬苗代湖的磐梯山的東南山麓，發掘了許多繩文時代甚至更古老的遺跡。在長濱、蟹澤濱以及三城潟的湖底都確認到了繩文時代到古墳時代的遺址。